Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYL1P12980 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYL1P12980 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LYL1P12980 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYL1P12980 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYL1P12980 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYL1P12980 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LYL1P12980 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYL1P12980 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYL1P12980 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYL1P12980 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYL1P12980 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYL1P12980 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYL1P12980 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYL1P12980 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYL1P12980 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYL1P12980 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYL1P12980 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYL1P12980 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYL1P12980 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYL1P12980 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYL1P12980 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYL1P12980 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYL1P12980 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYL1P12980 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYL1P12980 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYL1P12980 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYL1P12980 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYL1P12980 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYL1P12980 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYL1P12980 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYL1P12980 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYL1P12980 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYL1P12980 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYL1P12980 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYL1P12980 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYL1P12980 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYL1P12980 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYL1P12980 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYL1P12980 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYL1P12980 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYL1P12980 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYL1P12980 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYL1P12980 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYL1P12980 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYL1P12980 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYL1P12980 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYL1P12980 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYL1P12980 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYL1P12980 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYL1P12980 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYL1P12980 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYL1P12980 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYL1P12980 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYL1P12980 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYL1P12980 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYL1P12980 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYL1P12980 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYL1P12980 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYL1P12980 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYL1P12980 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYL1P12980 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYL1P12980 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYL1P12980 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYL1P12980 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYL1P12980 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYL1P12980 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYL1P12980 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYL1P12980 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LYL1P12980 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYL1P12980 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYL1P12980 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYL1P12980 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYL1P12980 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LYL1P12980 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYL1P12980 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LYL1P12980 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYL1P12980 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYL1P12980 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYL1P12980 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LYL1P12980 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYL1P12980 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYL1P12980 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYL1P12980 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYL1P12980 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYL1P12980 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYL1P12980 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYL1P12980 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYL1P12980 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYL1P12980 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYL1P12980 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYL1P12980 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYL1P12980 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYL1P12980 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYL1P12980 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYL1P12980 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYL1P12980 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYL1P12980 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYL1P12980 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYL1P12980 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms