Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD28P10747 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD28P10747 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD28P10747 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD28P10747 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD28P10747 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD28P10747 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD28P10747 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD28P10747 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD28P10747 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD28P10747 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD28P10747 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD28P10747 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD28P10747 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD28P10747 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD28P10747 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD28P10747 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD28P10747 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD28P10747 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD28P10747 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD28P10747 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD28P10747 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD28P10747 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CD28P10747 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD28P10747 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD28P10747 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD28P10747 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD28P10747 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD28P10747 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD28P10747 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD28P10747 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD28P10747 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD28P10747 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD28P10747 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD28P10747 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD28P10747 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD28P10747 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD28P10747 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD28P10747 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD28P10747 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD28P10747 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD28P10747 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD28P10747 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD28P10747 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD28P10747 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD28P10747 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD28P10747 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD28P10747 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD28P10747 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD28P10747 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CD28P10747 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD28P10747 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD28P10747 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD28P10747 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD28P10747 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD28P10747 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD28P10747 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD28P10747 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD28P10747 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD28P10747 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD28P10747 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD28P10747 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD28P10747 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD28P10747 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD28P10747 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD28P10747 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD28P10747 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD28P10747 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD28P10747 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD28P10747 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD28P10747 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD28P10747 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD28P10747 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD28P10747 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD28P10747 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD28P10747 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD28P10747 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CD28P10747 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD28P10747 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD28P10747 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD28P10747 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD28P10747 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD28P10747 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD28P10747 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD28P10747 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD28P10747 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD28P10747 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD28P10747 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD28P10747 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD28P10747 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD28P10747 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CD28P10747 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD28P10747 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD28P10747 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD28P10747 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD28P10747 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD28P10747 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD28P10747 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD28P10747 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD28P10747 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms