Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HKR1P10072 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HKR1P10072 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HKR1P10072 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HKR1P10072 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HKR1P10072 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HKR1P10072 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HKR1P10072 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HKR1P10072 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HKR1P10072 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HKR1P10072 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HKR1P10072 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKR1P10072 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKR1P10072 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HKR1P10072 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKR1P10072 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKR1P10072 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HKR1P10072 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HKR1P10072 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HKR1P10072 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HKR1P10072 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HKR1P10072 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HKR1P10072 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HKR1P10072 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HKR1P10072 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKR1P10072 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKR1P10072 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKR1P10072 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HKR1P10072 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HKR1P10072 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HKR1P10072 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HKR1P10072 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HKR1P10072 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HKR1P10072 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HKR1P10072 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HKR1P10072 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HKR1P10072 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HKR1P10072 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HKR1P10072 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HKR1P10072 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HKR1P10072 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HKR1P10072 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HKR1P10072 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HKR1P10072 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HKR1P10072 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HKR1P10072 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HKR1P10072 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HKR1P10072 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HKR1P10072 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HKR1P10072 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HKR1P10072 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HKR1P10072 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HKR1P10072 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HKR1P10072 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HKR1P10072 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HKR1P10072 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HKR1P10072 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HKR1P10072 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HKR1P10072 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HKR1P10072 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HKR1P10072 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HKR1P10072 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HKR1P10072 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HKR1P10072 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HKR1P10072 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HKR1P10072 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HKR1P10072 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HKR1P10072 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HKR1P10072 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HKR1P10072 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HKR1P10072 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HKR1P10072 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HKR1P10072 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HKR1P10072 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HKR1P10072 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HKR1P10072 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HKR1P10072 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HKR1P10072 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HKR1P10072 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HKR1P10072 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HKR1P10072 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HKR1P10072 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HKR1P10072 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HKR1P10072 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HKR1P10072 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HKR1P10072 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HKR1P10072 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HKR1P10072 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HKR1P10072 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HKR1P10072 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HKR1P10072 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HKR1P10072 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HKR1P10072 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HKR1P10072 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HKR1P10072 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HKR1P10072 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HKR1P10072 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HKR1P10072 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HKR1P10072 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HKR1P10072 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms