Protein–RNA interactions for Protein: P0DP04

IGHV3-43D, Immunoglobulin heavy variable 3-43D, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-43DP0DP04 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV3-43DP0DP04 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV3-43DP0DP04 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-43DP0DP04 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-43DP0DP04 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-43DP0DP04 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-43DP0DP04 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGHV3-43DP0DP04 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-43DP0DP04 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-43DP0DP04 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-43DP0DP04 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHV3-43DP0DP04 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-43DP0DP04 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-43DP0DP04 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV3-43DP0DP04 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV3-43DP0DP04 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-43DP0DP04 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-43DP0DP04 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-43DP0DP04 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-43DP0DP04 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-43DP0DP04 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-43DP0DP04 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-43DP0DP04 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHV3-43DP0DP04 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-43DP0DP04 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-43DP0DP04 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-43DP0DP04 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-43DP0DP04 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-43DP0DP04 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-43DP0DP04 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IGHV3-43DP0DP04 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-43DP0DP04 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-43DP0DP04 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-43DP0DP04 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-43DP0DP04 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-43DP0DP04 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-43DP0DP04 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-43DP0DP04 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-43DP0DP04 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms