Protein–RNA interactions for Protein: P0DH78

RNF224, RING finger protein 224, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF224P0DH78 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF224P0DH78 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF224P0DH78 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF224P0DH78 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF224P0DH78 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF224P0DH78 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF224P0DH78 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF224P0DH78 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF224P0DH78 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF224P0DH78 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF224P0DH78 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF224P0DH78 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF224P0DH78 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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