Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PNMA6AP0CW24 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PNMA6AP0CW24 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PNMA6AP0CW24 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PNMA6AP0CW24 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PNMA6AP0CW24 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PNMA6AP0CW24 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PNMA6AP0CW24 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PNMA6AP0CW24 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PNMA6AP0CW24 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PNMA6AP0CW24 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PNMA6AP0CW24 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PNMA6AP0CW24 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PNMA6AP0CW24 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PNMA6AP0CW24 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PNMA6AP0CW24 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PNMA6AP0CW24 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PNMA6AP0CW24 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PNMA6AP0CW24 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PNMA6AP0CW24 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PNMA6AP0CW24 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PNMA6AP0CW24 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PNMA6AP0CW24 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PNMA6AP0CW24 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PNMA6AP0CW24 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PNMA6AP0CW24 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PNMA6AP0CW24 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PNMA6AP0CW24 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PNMA6AP0CW24 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PNMA6AP0CW24 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNMA6AP0CW24 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNMA6AP0CW24 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PNMA6AP0CW24 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PNMA6AP0CW24 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PNMA6AP0CW24 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PNMA6AP0CW24 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PNMA6AP0CW24 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PNMA6AP0CW24 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PNMA6AP0CW24 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PNMA6AP0CW24 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PNMA6AP0CW24 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PNMA6AP0CW24 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PNMA6AP0CW24 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PNMA6AP0CW24 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PNMA6AP0CW24 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PNMA6AP0CW24 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PNMA6AP0CW24 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PNMA6AP0CW24 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PNMA6AP0CW24 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PNMA6AP0CW24 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PNMA6AP0CW24 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PNMA6AP0CW24 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PNMA6AP0CW24 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PNMA6AP0CW24 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PNMA6AP0CW24 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PNMA6AP0CW24 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PNMA6AP0CW24 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PNMA6AP0CW24 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PNMA6AP0CW24 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PNMA6AP0CW24 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PNMA6AP0CW24 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PNMA6AP0CW24 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PNMA6AP0CW24 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PNMA6AP0CW24 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PNMA6AP0CW24 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PNMA6AP0CW24 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms