Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PKHD1P08F94 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKHD1P08F94 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKHD1P08F94 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKHD1P08F94 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKHD1P08F94 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKHD1P08F94 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKHD1P08F94 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKHD1P08F94 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKHD1P08F94 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKHD1P08F94 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKHD1P08F94 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PKHD1P08F94 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKHD1P08F94 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKHD1P08F94 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKHD1P08F94 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKHD1P08F94 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKHD1P08F94 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKHD1P08F94 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PKHD1P08F94 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKHD1P08F94 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKHD1P08F94 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKHD1P08F94 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKHD1P08F94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKHD1P08F94 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKHD1P08F94 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKHD1P08F94 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKHD1P08F94 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKHD1P08F94 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PKHD1P08F94 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKHD1P08F94 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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