Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB1P08183 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB1P08183 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB1P08183 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB1P08183 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB1P08183 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB1P08183 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB1P08183 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCB1P08183 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB1P08183 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB1P08183 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB1P08183 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCB1P08183 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCB1P08183 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCB1P08183 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB1P08183 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB1P08183 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB1P08183 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB1P08183 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB1P08183 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB1P08183 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB1P08183 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB1P08183 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB1P08183 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB1P08183 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB1P08183 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB1P08183 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB1P08183 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB1P08183 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB1P08183 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB1P08183 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB1P08183 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB1P08183 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB1P08183 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB1P08183 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB1P08183 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB1P08183 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB1P08183 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB1P08183 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB1P08183 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB1P08183 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB1P08183 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB1P08183 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB1P08183 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB1P08183 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB1P08183 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB1P08183 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB1P08183 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB1P08183 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB1P08183 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB1P08183 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms