Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC1P07992 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC1P07992 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC1P07992 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC1P07992 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC1P07992 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC1P07992 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC1P07992 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERCC1P07992 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC1P07992 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC1P07992 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC1P07992 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC1P07992 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC1P07992 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC1P07992 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC1P07992 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC1P07992 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC1P07992 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC1P07992 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC1P07992 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC1P07992 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC1P07992 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC1P07992 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC1P07992 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC1P07992 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC1P07992 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC1P07992 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC1P07992 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC1P07992 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC1P07992 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC1P07992 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC1P07992 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC1P07992 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC1P07992 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC1P07992 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC1P07992 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC1P07992 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC1P07992 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC1P07992 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC1P07992 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC1P07992 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC1P07992 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC1P07992 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC1P07992 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC1P07992 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC1P07992 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC1P07992 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC1P07992 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms