Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSN3P07498 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSN3P07498 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSN3P07498 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSN3P07498 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSN3P07498 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSN3P07498 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSN3P07498 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSN3P07498 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSN3P07498 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSN3P07498 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSN3P07498 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSN3P07498 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSN3P07498 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSN3P07498 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSN3P07498 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSN3P07498 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSN3P07498 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSN3P07498 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSN3P07498 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSN3P07498 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSN3P07498 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSN3P07498 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSN3P07498 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSN3P07498 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSN3P07498 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSN3P07498 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSN3P07498 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSN3P07498 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSN3P07498 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSN3P07498 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CSN3P07498 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CSN3P07498 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSN3P07498 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSN3P07498 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSN3P07498 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSN3P07498 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSN3P07498 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSN3P07498 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSN3P07498 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSN3P07498 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSN3P07498 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSN3P07498 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSN3P07498 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSN3P07498 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSN3P07498 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSN3P07498 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSN3P07498 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSN3P07498 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSN3P07498 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSN3P07498 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSN3P07498 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSN3P07498 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSN3P07498 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSN3P07498 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSN3P07498 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSN3P07498 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSN3P07498 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSN3P07498 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSN3P07498 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSN3P07498 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSN3P07498 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSN3P07498 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSN3P07498 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSN3P07498 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSN3P07498 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSN3P07498 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSN3P07498 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSN3P07498 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSN3P07498 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSN3P07498 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSN3P07498 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSN3P07498 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSN3P07498 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSN3P07498 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSN3P07498 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSN3P07498 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSN3P07498 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSN3P07498 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSN3P07498 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSN3P07498 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSN3P07498 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSN3P07498 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSN3P07498 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSN3P07498 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSN3P07498 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSN3P07498 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSN3P07498 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSN3P07498 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSN3P07498 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSN3P07498 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSN3P07498 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSN3P07498 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSN3P07498 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSN3P07498 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CSN3P07498 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSN3P07498 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSN3P07498 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSN3P07498 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CSN3P07498 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms