Protein–RNA interactions for Protein: P06396

GSN, Gelsolin, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSNP06396 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSNP06396 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSNP06396 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSNP06396 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSNP06396 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSNP06396 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSNP06396 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GSNP06396 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSNP06396 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GSNP06396 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GSNP06396 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GSNP06396 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GSNP06396 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSNP06396 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSNP06396 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSNP06396 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSNP06396 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSNP06396 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSNP06396 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSNP06396 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSNP06396 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSNP06396 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSNP06396 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSNP06396 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSNP06396 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSNP06396 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSNP06396 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSNP06396 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSNP06396 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSNP06396 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSNP06396 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSNP06396 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GSNP06396 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GSNP06396 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GSNP06396 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSNP06396 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSNP06396 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSNP06396 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSNP06396 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSNP06396 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSNP06396 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSNP06396 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSNP06396 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GSNP06396 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSNP06396 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSNP06396 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSNP06396 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSNP06396 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
GSNP06396 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSNP06396 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSNP06396 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSNP06396 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSNP06396 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSNP06396 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSNP06396 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSNP06396 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSNP06396 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSNP06396 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSNP06396 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSNP06396 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSNP06396 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSNP06396 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSNP06396 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSNP06396 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GSNP06396 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSNP06396 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSNP06396 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSNP06396 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSNP06396 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSNP06396 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GSNP06396 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GSNP06396 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSNP06396 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSNP06396 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSNP06396 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSNP06396 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSNP06396 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSNP06396 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSNP06396 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSNP06396 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GSNP06396 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GSNP06396 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSNP06396 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSNP06396 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSNP06396 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSNP06396 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSNP06396 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSNP06396 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSNP06396 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSNP06396 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSNP06396 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSNP06396 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSNP06396 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSNP06396 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSNP06396 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSNP06396 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSNP06396 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSNP06396 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSNP06396 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSNP06396 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms