Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAF1P04049 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAF1P04049 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAF1P04049 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAF1P04049 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAF1P04049 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAF1P04049 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAF1P04049 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAF1P04049 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAF1P04049 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAF1P04049 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAF1P04049 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAF1P04049 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAF1P04049 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAF1P04049 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAF1P04049 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAF1P04049 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAF1P04049 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAF1P04049 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAF1P04049 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAF1P04049 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAF1P04049 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAF1P04049 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAF1P04049 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAF1P04049 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAF1P04049 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAF1P04049 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAF1P04049 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAF1P04049 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAF1P04049 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAF1P04049 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAF1P04049 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAF1P04049 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAF1P04049 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAF1P04049 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAF1P04049 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAF1P04049 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAF1P04049 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAF1P04049 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAF1P04049 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAF1P04049 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAF1P04049 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAF1P04049 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAF1P04049 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAF1P04049 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAF1P04049 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAF1P04049 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAF1P04049 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAF1P04049 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAF1P04049 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAF1P04049 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAF1P04049 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAF1P04049 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAF1P04049 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAF1P04049 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAF1P04049 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAF1P04049 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAF1P04049 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAF1P04049 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAF1P04049 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAF1P04049 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAF1P04049 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAF1P04049 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAF1P04049 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAF1P04049 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAF1P04049 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAF1P04049 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAF1P04049 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAF1P04049 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAF1P04049 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAF1P04049 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAF1P04049 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAF1P04049 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAF1P04049 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAF1P04049 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAF1P04049 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAF1P04049 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAF1P04049 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAF1P04049 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAF1P04049 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAF1P04049 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAF1P04049 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAF1P04049 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAF1P04049 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAF1P04049 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAF1P04049 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAF1P04049 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAF1P04049 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAF1P04049 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAF1P04049 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAF1P04049 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAF1P04049 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAF1P04049 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAF1P04049 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAF1P04049 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAF1P04049 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAF1P04049 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAF1P04049 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAF1P04049 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAF1P04049 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms