Protein–RNA interactions for Protein: P03897

MT-ND3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND3P03897 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MT-ND3P03897 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MT-ND3P03897 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MT-ND3P03897 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MT-ND3P03897 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MT-ND3P03897 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MT-ND3P03897 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MT-ND3P03897 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MT-ND3P03897 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MT-ND3P03897 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MT-ND3P03897 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MT-ND3P03897 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MT-ND3P03897 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MT-ND3P03897 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MT-ND3P03897 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MT-ND3P03897 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MT-ND3P03897 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MT-ND3P03897 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MT-ND3P03897 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MT-ND3P03897 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MT-ND3P03897 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MT-ND3P03897 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MT-ND3P03897 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MT-ND3P03897 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MT-ND3P03897 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MT-ND3P03897 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MT-ND3P03897 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MT-ND3P03897 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MT-ND3P03897 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MT-ND3P03897 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MT-ND3P03897 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MT-ND3P03897 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MT-ND3P03897 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MT-ND3P03897 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MT-ND3P03897 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MT-ND3P03897 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MT-ND3P03897 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MT-ND3P03897 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MT-ND3P03897 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MT-ND3P03897 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MT-ND3P03897 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MT-ND3P03897 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MT-ND3P03897 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MT-ND3P03897 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MT-ND3P03897 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MT-ND3P03897 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MT-ND3P03897 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MT-ND3P03897 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MT-ND3P03897 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MT-ND3P03897 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MT-ND3P03897 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MT-ND3P03897 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MT-ND3P03897 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MT-ND3P03897 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MT-ND3P03897 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MT-ND3P03897 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MT-ND3P03897 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MT-ND3P03897 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MT-ND3P03897 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MT-ND3P03897 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MT-ND3P03897 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MT-ND3P03897 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MT-ND3P03897 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MT-ND3P03897 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MT-ND3P03897 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MT-ND3P03897 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MT-ND3P03897 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MT-ND3P03897 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MT-ND3P03897 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MT-ND3P03897 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MT-ND3P03897 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MT-ND3P03897 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MT-ND3P03897 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MT-ND3P03897 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MT-ND3P03897 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MT-ND3P03897 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MT-ND3P03897 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms