Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGKV3-15P01624 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGKV3-15P01624 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGKV3-15P01624 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV3-15P01624 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV3-15P01624 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV3-15P01624 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV3-15P01624 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV3-15P01624 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGKV3-15P01624 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IGKV3-15P01624 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV3-15P01624 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV3-15P01624 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGKV3-15P01624 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGKV3-15P01624 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGKV3-15P01624 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGKV3-15P01624 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGKV3-15P01624 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV3-15P01624 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV3-15P01624 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV3-15P01624 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV3-15P01624 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGKV3-15P01624 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGKV3-15P01624 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV3-15P01624 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGKV3-15P01624 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGKV3-15P01624 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGKV3-15P01624 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGKV3-15P01624 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGKV3-15P01624 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV3-15P01624 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV3-15P01624 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV3-15P01624 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV3-15P01624 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGKV3-15P01624 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGKV3-15P01624 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGKV3-15P01624 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGKV3-15P01624 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGKV3-15P01624 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGKV3-15P01624 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGKV3-15P01624 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGKV3-15P01624 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGKV3-15P01624 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGKV3-15P01624 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGKV3-15P01624 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGKV3-15P01624 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGKV3-15P01624 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGKV3-15P01624 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGKV3-15P01624 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IGKV3-15P01624 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGKV3-15P01624 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGKV3-15P01624 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IGKV3-15P01624 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGKV3-15P01624 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGKV3-15P01624 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGKV3-15P01624 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGKV3-15P01624 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGKV3-15P01624 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms