Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHEK2O96017 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHEK2O96017 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHEK2O96017 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHEK2O96017 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHEK2O96017 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHEK2O96017 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHEK2O96017 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHEK2O96017 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHEK2O96017 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHEK2O96017 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHEK2O96017 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHEK2O96017 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHEK2O96017 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHEK2O96017 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHEK2O96017 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHEK2O96017 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHEK2O96017 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHEK2O96017 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHEK2O96017 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHEK2O96017 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHEK2O96017 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHEK2O96017 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHEK2O96017 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHEK2O96017 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHEK2O96017 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHEK2O96017 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHEK2O96017 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHEK2O96017 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHEK2O96017 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHEK2O96017 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHEK2O96017 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHEK2O96017 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHEK2O96017 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHEK2O96017 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHEK2O96017 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHEK2O96017 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHEK2O96017 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHEK2O96017 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHEK2O96017 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHEK2O96017 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHEK2O96017 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHEK2O96017 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHEK2O96017 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHEK2O96017 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHEK2O96017 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHEK2O96017 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHEK2O96017 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHEK2O96017 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHEK2O96017 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHEK2O96017 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms