Protein–RNA interactions for Protein: O96005

CLPTM1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1O96005 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLPTM1O96005 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLPTM1O96005 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLPTM1O96005 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLPTM1O96005 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLPTM1O96005 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLPTM1O96005 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLPTM1O96005 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLPTM1O96005 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLPTM1O96005 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLPTM1O96005 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLPTM1O96005 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLPTM1O96005 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLPTM1O96005 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLPTM1O96005 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLPTM1O96005 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLPTM1O96005 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLPTM1O96005 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLPTM1O96005 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLPTM1O96005 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLPTM1O96005 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLPTM1O96005 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLPTM1O96005 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLPTM1O96005 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLPTM1O96005 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLPTM1O96005 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLPTM1O96005 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLPTM1O96005 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLPTM1O96005 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLPTM1O96005 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLPTM1O96005 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLPTM1O96005 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPTM1O96005 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLPTM1O96005 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLPTM1O96005 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLPTM1O96005 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLPTM1O96005 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLPTM1O96005 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLPTM1O96005 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLPTM1O96005 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLPTM1O96005 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLPTM1O96005 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLPTM1O96005 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLPTM1O96005 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLPTM1O96005 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLPTM1O96005 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLPTM1O96005 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLPTM1O96005 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLPTM1O96005 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLPTM1O96005 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLPTM1O96005 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLPTM1O96005 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLPTM1O96005 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLPTM1O96005 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLPTM1O96005 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLPTM1O96005 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLPTM1O96005 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLPTM1O96005 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLPTM1O96005 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLPTM1O96005 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLPTM1O96005 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLPTM1O96005 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLPTM1O96005 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLPTM1O96005 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms