Protein–RNA interactions for Protein: O95478

NSA2, Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSA2O95478 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSA2O95478 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NSA2O95478 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSA2O95478 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NSA2O95478 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSA2O95478 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NSA2O95478 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSA2O95478 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSA2O95478 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NSA2O95478 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NSA2O95478 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSA2O95478 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSA2O95478 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSA2O95478 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSA2O95478 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSA2O95478 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSA2O95478 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSA2O95478 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSA2O95478 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSA2O95478 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSA2O95478 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSA2O95478 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSA2O95478 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSA2O95478 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSA2O95478 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSA2O95478 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSA2O95478 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSA2O95478 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSA2O95478 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSA2O95478 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSA2O95478 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSA2O95478 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NSA2O95478 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSA2O95478 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSA2O95478 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NSA2O95478 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NSA2O95478 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSA2O95478 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSA2O95478 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSA2O95478 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSA2O95478 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSA2O95478 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSA2O95478 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSA2O95478 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSA2O95478 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSA2O95478 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSA2O95478 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSA2O95478 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSA2O95478 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSA2O95478 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSA2O95478 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSA2O95478 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSA2O95478 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSA2O95478 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSA2O95478 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSA2O95478 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSA2O95478 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSA2O95478 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSA2O95478 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSA2O95478 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSA2O95478 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSA2O95478 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSA2O95478 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSA2O95478 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSA2O95478 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSA2O95478 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSA2O95478 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSA2O95478 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSA2O95478 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSA2O95478 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSA2O95478 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSA2O95478 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSA2O95478 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NSA2O95478 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSA2O95478 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSA2O95478 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSA2O95478 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NSA2O95478 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSA2O95478 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSA2O95478 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSA2O95478 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSA2O95478 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NSA2O95478 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSA2O95478 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSA2O95478 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSA2O95478 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NSA2O95478 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSA2O95478 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSA2O95478 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSA2O95478 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NSA2O95478 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NSA2O95478 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSA2O95478 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSA2O95478 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSA2O95478 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSA2O95478 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSA2O95478 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSA2O95478 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSA2O95478 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSA2O95478 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms