Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SVILO95425 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SVILO95425 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SVILO95425 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SVILO95425 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SVILO95425 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SVILO95425 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SVILO95425 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SVILO95425 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SVILO95425 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SVILO95425 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SVILO95425 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SVILO95425 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SVILO95425 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SVILO95425 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SVILO95425 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SVILO95425 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SVILO95425 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SVILO95425 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SVILO95425 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SVILO95425 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SVILO95425 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SVILO95425 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SVILO95425 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SVILO95425 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SVILO95425 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SVILO95425 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SVILO95425 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SVILO95425 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SVILO95425 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SVILO95425 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SVILO95425 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SVILO95425 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SVILO95425 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SVILO95425 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SVILO95425 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SVILO95425 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SVILO95425 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SVILO95425 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SVILO95425 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SVILO95425 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SVILO95425 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SVILO95425 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SVILO95425 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SVILO95425 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SVILO95425 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SVILO95425 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SVILO95425 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SVILO95425 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SVILO95425 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SVILO95425 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SVILO95425 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SVILO95425 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SVILO95425 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SVILO95425 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SVILO95425 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SVILO95425 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SVILO95425 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SVILO95425 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SVILO95425 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SVILO95425 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SVILO95425 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SVILO95425 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SVILO95425 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SVILO95425 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SVILO95425 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SVILO95425 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SVILO95425 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SVILO95425 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SVILO95425 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SVILO95425 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SVILO95425 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SVILO95425 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SVILO95425 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SVILO95425 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SVILO95425 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SVILO95425 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SVILO95425 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SVILO95425 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SVILO95425 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SVILO95425 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SVILO95425 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SVILO95425 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SVILO95425 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SVILO95425 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SVILO95425 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SVILO95425 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SVILO95425 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SVILO95425 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SVILO95425 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SVILO95425 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SVILO95425 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SVILO95425 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SVILO95425 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SVILO95425 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SVILO95425 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SVILO95425 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SVILO95425 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SVILO95425 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SVILO95425 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms