Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
KIF4AO95239 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIF4AO95239 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIF4AO95239 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIF4AO95239 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIF4AO95239 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIF4AO95239 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIF4AO95239 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
KIF4AO95239 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KIF4AO95239 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KIF4AO95239 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
KIF4AO95239 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIF4AO95239 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIF4AO95239 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIF4AO95239 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIF4AO95239 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIF4AO95239 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIF4AO95239 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIF4AO95239 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIF4AO95239 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIF4AO95239 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIF4AO95239 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIF4AO95239 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIF4AO95239 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIF4AO95239 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIF4AO95239 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIF4AO95239 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIF4AO95239 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIF4AO95239 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KIF4AO95239 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIF4AO95239 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIF4AO95239 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIF4AO95239 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIF4AO95239 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIF4AO95239 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
KIF4AO95239 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIF4AO95239 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIF4AO95239 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KIF4AO95239 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KIF4AO95239 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIF4AO95239 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIF4AO95239 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIF4AO95239 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIF4AO95239 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIF4AO95239 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
KIF4AO95239 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KIF4AO95239 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIF4AO95239 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIF4AO95239 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIF4AO95239 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF4AO95239 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF4AO95239 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIF4AO95239 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIF4AO95239 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF4AO95239 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF4AO95239 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF4AO95239 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF4AO95239 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF4AO95239 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF4AO95239 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF4AO95239 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF4AO95239 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIF4AO95239 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIF4AO95239 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIF4AO95239 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIF4AO95239 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIF4AO95239 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIF4AO95239 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIF4AO95239 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms