Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX3O95076 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX3O95076 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALX3O95076 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALX3O95076 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX3O95076 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALX3O95076 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALX3O95076 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX3O95076 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALX3O95076 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX3O95076 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX3O95076 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX3O95076 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX3O95076 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX3O95076 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX3O95076 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX3O95076 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX3O95076 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX3O95076 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX3O95076 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX3O95076 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX3O95076 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX3O95076 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX3O95076 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALX3O95076 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALX3O95076 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALX3O95076 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALX3O95076 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX3O95076 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX3O95076 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX3O95076 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX3O95076 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALX3O95076 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX3O95076 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALX3O95076 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX3O95076 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX3O95076 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX3O95076 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX3O95076 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX3O95076 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX3O95076 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALX3O95076 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ALX3O95076 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX3O95076 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALX3O95076 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX3O95076 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX3O95076 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALX3O95076 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALX3O95076 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ALX3O95076 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX3O95076 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX3O95076 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX3O95076 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX3O95076 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX3O95076 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX3O95076 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX3O95076 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX3O95076 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX3O95076 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX3O95076 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX3O95076 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX3O95076 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX3O95076 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX3O95076 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX3O95076 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX3O95076 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALX3O95076 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX3O95076 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX3O95076 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX3O95076 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX3O95076 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX3O95076 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX3O95076 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX3O95076 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX3O95076 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX3O95076 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX3O95076 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX3O95076 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX3O95076 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX3O95076 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX3O95076 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX3O95076 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX3O95076 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX3O95076 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX3O95076 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX3O95076 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX3O95076 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX3O95076 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX3O95076 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALX3O95076 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ALX3O95076 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALX3O95076 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALX3O95076 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALX3O95076 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALX3O95076 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALX3O95076 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALX3O95076 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALX3O95076 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALX3O95076 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALX3O95076 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms