Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PALMO75781 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PALMO75781 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PALMO75781 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PALMO75781 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PALMO75781 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PALMO75781 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PALMO75781 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PALMO75781 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PALMO75781 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALMO75781 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALMO75781 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALMO75781 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALMO75781 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PALMO75781 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PALMO75781 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PALMO75781 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PALMO75781 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PALMO75781 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PALMO75781 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PALMO75781 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PALMO75781 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PALMO75781 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PALMO75781 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PALMO75781 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PALMO75781 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PALMO75781 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PALMO75781 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PALMO75781 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PALMO75781 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PALMO75781 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PALMO75781 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PALMO75781 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PALMO75781 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PALMO75781 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PALMO75781 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PALMO75781 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PALMO75781 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PALMO75781 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PALMO75781 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PALMO75781 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PALMO75781 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PALMO75781 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PALMO75781 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PALMO75781 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PALMO75781 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PALMO75781 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PALMO75781 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PALMO75781 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PALMO75781 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PALMO75781 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PALMO75781 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PALMO75781 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PALMO75781 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALMO75781 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALMO75781 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALMO75781 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALMO75781 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALMO75781 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALMO75781 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PALMO75781 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PALMO75781 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALMO75781 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALMO75781 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALMO75781 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALMO75781 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PALMO75781 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALMO75781 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALMO75781 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALMO75781 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALMO75781 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PALMO75781 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALMO75781 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALMO75781 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALMO75781 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALMO75781 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALMO75781 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PALMO75781 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PALMO75781 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PALMO75781 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PALMO75781 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PALMO75781 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PALMO75781 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PALMO75781 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PALMO75781 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PALMO75781 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PALMO75781 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PALMO75781 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PALMO75781 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PALMO75781 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PALMO75781 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PALMO75781 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PALMO75781 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PALMO75781 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PALMO75781 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PALMO75781 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PALMO75781 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PALMO75781 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALMO75781 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALMO75781 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms