Protein–RNA interactions for Protein: O75677

RFPL1, Ret finger protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL1O75677 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFPL1O75677 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFPL1O75677 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFPL1O75677 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFPL1O75677 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFPL1O75677 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFPL1O75677 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFPL1O75677 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFPL1O75677 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFPL1O75677 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFPL1O75677 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFPL1O75677 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFPL1O75677 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFPL1O75677 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFPL1O75677 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFPL1O75677 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFPL1O75677 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFPL1O75677 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFPL1O75677 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFPL1O75677 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFPL1O75677 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFPL1O75677 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFPL1O75677 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFPL1O75677 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFPL1O75677 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFPL1O75677 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFPL1O75677 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFPL1O75677 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFPL1O75677 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RFPL1O75677 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFPL1O75677 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFPL1O75677 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFPL1O75677 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFPL1O75677 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFPL1O75677 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFPL1O75677 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFPL1O75677 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFPL1O75677 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFPL1O75677 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RFPL1O75677 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFPL1O75677 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFPL1O75677 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFPL1O75677 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFPL1O75677 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFPL1O75677 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFPL1O75677 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFPL1O75677 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFPL1O75677 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFPL1O75677 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFPL1O75677 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RFPL1O75677 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFPL1O75677 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFPL1O75677 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RFPL1O75677 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RFPL1O75677 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFPL1O75677 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFPL1O75677 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFPL1O75677 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
RFPL1O75677 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFPL1O75677 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFPL1O75677 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFPL1O75677 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFPL1O75677 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFPL1O75677 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFPL1O75677 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFPL1O75677 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFPL1O75677 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFPL1O75677 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RFPL1O75677 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFPL1O75677 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFPL1O75677 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFPL1O75677 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFPL1O75677 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFPL1O75677 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFPL1O75677 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFPL1O75677 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFPL1O75677 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms