Protein–RNA interactions for Protein: O75628

REM1, GTP-binding protein REM 1, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REM1O75628 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REM1O75628 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REM1O75628 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REM1O75628 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REM1O75628 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REM1O75628 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REM1O75628 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REM1O75628 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
REM1O75628 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
REM1O75628 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
REM1O75628 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
REM1O75628 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
REM1O75628 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
REM1O75628 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
REM1O75628 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
REM1O75628 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
REM1O75628 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
REM1O75628 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
REM1O75628 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
REM1O75628 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REM1O75628 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REM1O75628 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REM1O75628 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REM1O75628 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REM1O75628 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REM1O75628 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REM1O75628 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REM1O75628 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REM1O75628 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REM1O75628 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
REM1O75628 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
REM1O75628 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
REM1O75628 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
REM1O75628 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
REM1O75628 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REM1O75628 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REM1O75628 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REM1O75628 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REM1O75628 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REM1O75628 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REM1O75628 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REM1O75628 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REM1O75628 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REM1O75628 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REM1O75628 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REM1O75628 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
REM1O75628 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
REM1O75628 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
REM1O75628 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REM1O75628 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REM1O75628 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
REM1O75628 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
REM1O75628 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
REM1O75628 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
REM1O75628 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
REM1O75628 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
REM1O75628 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REM1O75628 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
REM1O75628 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
REM1O75628 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
REM1O75628 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
REM1O75628 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
REM1O75628 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
REM1O75628 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
REM1O75628 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
REM1O75628 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
REM1O75628 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
REM1O75628 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REM1O75628 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REM1O75628 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
REM1O75628 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
REM1O75628 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
REM1O75628 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REM1O75628 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REM1O75628 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REM1O75628 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REM1O75628 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REM1O75628 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REM1O75628 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REM1O75628 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REM1O75628 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REM1O75628 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REM1O75628 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REM1O75628 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REM1O75628 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REM1O75628 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
REM1O75628 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REM1O75628 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REM1O75628 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REM1O75628 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
REM1O75628 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REM1O75628 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REM1O75628 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REM1O75628 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REM1O75628 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REM1O75628 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REM1O75628 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
REM1O75628 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REM1O75628 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REM1O75628 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms