Protein–RNA interactions for Protein: O60906

SMPD2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD2O60906 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD2O60906 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD2O60906 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD2O60906 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD2O60906 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD2O60906 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD2O60906 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD2O60906 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD2O60906 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD2O60906 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD2O60906 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD2O60906 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD2O60906 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD2O60906 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD2O60906 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD2O60906 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD2O60906 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD2O60906 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD2O60906 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMPD2O60906 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD2O60906 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD2O60906 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD2O60906 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD2O60906 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD2O60906 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD2O60906 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD2O60906 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD2O60906 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD2O60906 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD2O60906 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD2O60906 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD2O60906 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD2O60906 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD2O60906 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD2O60906 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD2O60906 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD2O60906 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD2O60906 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD2O60906 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD2O60906 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms