Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC19A2O60779 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC19A2O60779 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC19A2O60779 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC19A2O60779 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC19A2O60779 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC19A2O60779 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC19A2O60779 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC19A2O60779 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC19A2O60779 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC19A2O60779 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC19A2O60779 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC19A2O60779 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC19A2O60779 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC19A2O60779 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC19A2O60779 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC19A2O60779 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC19A2O60779 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC19A2O60779 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC19A2O60779 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC19A2O60779 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC19A2O60779 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC19A2O60779 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC19A2O60779 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC19A2O60779 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC19A2O60779 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC19A2O60779 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC19A2O60779 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC19A2O60779 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC19A2O60779 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC19A2O60779 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC19A2O60779 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC19A2O60779 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC19A2O60779 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC19A2O60779 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC19A2O60779 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC19A2O60779 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC19A2O60779 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC19A2O60779 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC19A2O60779 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC19A2O60779 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC19A2O60779 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC19A2O60779 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC19A2O60779 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC19A2O60779 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC19A2O60779 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC19A2O60779 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC19A2O60779 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC19A2O60779 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC19A2O60779 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC19A2O60779 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC19A2O60779 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC19A2O60779 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC19A2O60779 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC19A2O60779 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC19A2O60779 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC19A2O60779 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC19A2O60779 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC19A2O60779 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC19A2O60779 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC19A2O60779 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC19A2O60779 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC19A2O60779 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC19A2O60779 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC19A2O60779 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC19A2O60779 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC19A2O60779 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC19A2O60779 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC19A2O60779 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC19A2O60779 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC19A2O60779 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC19A2O60779 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC19A2O60779 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC19A2O60779 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC19A2O60779 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC19A2O60779 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC19A2O60779 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms