Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA3O43365 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA3O43365 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA3O43365 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA3O43365 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA3O43365 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA3O43365 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA3O43365 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA3O43365 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA3O43365 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA3O43365 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA3O43365 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA3O43365 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA3O43365 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA3O43365 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA3O43365 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA3O43365 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA3O43365 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA3O43365 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA3O43365 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA3O43365 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA3O43365 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA3O43365 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA3O43365 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA3O43365 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA3O43365 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA3O43365 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA3O43365 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA3O43365 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA3O43365 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA3O43365 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA3O43365 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA3O43365 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA3O43365 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA3O43365 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA3O43365 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA3O43365 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA3O43365 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA3O43365 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA3O43365 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA3O43365 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA3O43365 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA3O43365 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA3O43365 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA3O43365 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA3O43365 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA3O43365 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA3O43365 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA3O43365 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA3O43365 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA3O43365 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA3O43365 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA3O43365 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA3O43365 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA3O43365 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA3O43365 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA3O43365 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA3O43365 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA3O43365 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA3O43365 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA3O43365 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXA3O43365 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA3O43365 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA3O43365 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA3O43365 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA3O43365 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA3O43365 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA3O43365 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA3O43365 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA3O43365 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA3O43365 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA3O43365 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA3O43365 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA3O43365 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA3O43365 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA3O43365 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA3O43365 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA3O43365 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms