Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VILLO15195 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VILLO15195 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VILLO15195 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VILLO15195 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VILLO15195 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VILLO15195 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VILLO15195 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VILLO15195 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VILLO15195 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VILLO15195 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VILLO15195 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VILLO15195 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VILLO15195 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VILLO15195 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VILLO15195 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VILLO15195 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VILLO15195 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VILLO15195 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VILLO15195 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VILLO15195 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VILLO15195 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VILLO15195 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VILLO15195 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VILLO15195 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VILLO15195 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VILLO15195 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VILLO15195 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VILLO15195 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VILLO15195 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VILLO15195 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VILLO15195 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VILLO15195 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VILLO15195 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VILLO15195 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VILLO15195 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VILLO15195 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VILLO15195 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VILLO15195 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VILLO15195 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VILLO15195 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VILLO15195 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VILLO15195 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VILLO15195 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VILLO15195 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VILLO15195 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VILLO15195 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VILLO15195 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VILLO15195 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VILLO15195 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
VILLO15195 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VILLO15195 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VILLO15195 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VILLO15195 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VILLO15195 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VILLO15195 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VILLO15195 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VILLO15195 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VILLO15195 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VILLO15195 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VILLO15195 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VILLO15195 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VILLO15195 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VILLO15195 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VILLO15195 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VILLO15195 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VILLO15195 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VILLO15195 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VILLO15195 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VILLO15195 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VILLO15195 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VILLO15195 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VILLO15195 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VILLO15195 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VILLO15195 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VILLO15195 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VILLO15195 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VILLO15195 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VILLO15195 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VILLO15195 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VILLO15195 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VILLO15195 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VILLO15195 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VILLO15195 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VILLO15195 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VILLO15195 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VILLO15195 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VILLO15195 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VILLO15195 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VILLO15195 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VILLO15195 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VILLO15195 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VILLO15195 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VILLO15195 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms