Protein–RNA interactions for Protein: O14966

RAB29, Ras-related protein Rab-7L1, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB29O14966 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB29O14966 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB29O14966 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB29O14966 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB29O14966 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB29O14966 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB29O14966 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB29O14966 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB29O14966 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB29O14966 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB29O14966 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB29O14966 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB29O14966 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB29O14966 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB29O14966 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB29O14966 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB29O14966 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB29O14966 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB29O14966 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB29O14966 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB29O14966 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB29O14966 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB29O14966 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB29O14966 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB29O14966 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB29O14966 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB29O14966 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB29O14966 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB29O14966 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB29O14966 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB29O14966 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB29O14966 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB29O14966 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB29O14966 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB29O14966 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB29O14966 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB29O14966 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB29O14966 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB29O14966 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB29O14966 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB29O14966 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB29O14966 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB29O14966 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB29O14966 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB29O14966 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB29O14966 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB29O14966 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB29O14966 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB29O14966 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB29O14966 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB29O14966 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB29O14966 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB29O14966 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB29O14966 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB29O14966 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB29O14966 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB29O14966 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB29O14966 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB29O14966 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB29O14966 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB29O14966 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB29O14966 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB29O14966 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB29O14966 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB29O14966 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB29O14966 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB29O14966 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB29O14966 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB29O14966 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB29O14966 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB29O14966 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB29O14966 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB29O14966 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB29O14966 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB29O14966 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB29O14966 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB29O14966 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB29O14966 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB29O14966 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB29O14966 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB29O14966 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB29O14966 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB29O14966 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB29O14966 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB29O14966 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB29O14966 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB29O14966 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB29O14966 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB29O14966 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB29O14966 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB29O14966 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB29O14966 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB29O14966 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB29O14966 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB29O14966 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB29O14966 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB29O14966 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB29O14966 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB29O14966 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB29O14966 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms