Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LIN7AO14910 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIN7AO14910 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIN7AO14910 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIN7AO14910 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIN7AO14910 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LIN7AO14910 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LIN7AO14910 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LIN7AO14910 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIN7AO14910 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIN7AO14910 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIN7AO14910 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LIN7AO14910 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LIN7AO14910 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LIN7AO14910 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LIN7AO14910 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LIN7AO14910 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LIN7AO14910 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LIN7AO14910 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LIN7AO14910 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LIN7AO14910 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LIN7AO14910 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LIN7AO14910 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LIN7AO14910 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LIN7AO14910 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LIN7AO14910 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LIN7AO14910 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LIN7AO14910 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LIN7AO14910 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LIN7AO14910 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN7AO14910 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN7AO14910 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN7AO14910 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LIN7AO14910 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LIN7AO14910 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LIN7AO14910 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIN7AO14910 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIN7AO14910 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LIN7AO14910 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LIN7AO14910 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIN7AO14910 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIN7AO14910 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIN7AO14910 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIN7AO14910 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIN7AO14910 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LIN7AO14910 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LIN7AO14910 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIN7AO14910 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIN7AO14910 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIN7AO14910 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIN7AO14910 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LIN7AO14910 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LIN7AO14910 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LIN7AO14910 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LIN7AO14910 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIN7AO14910 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIN7AO14910 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIN7AO14910 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIN7AO14910 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN7AO14910 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN7AO14910 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIN7AO14910 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIN7AO14910 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIN7AO14910 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LIN7AO14910 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LIN7AO14910 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIN7AO14910 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIN7AO14910 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIN7AO14910 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIN7AO14910 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIN7AO14910 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIN7AO14910 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN7AO14910 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN7AO14910 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN7AO14910 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms