Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GIPC1O14908 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GIPC1O14908 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GIPC1O14908 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GIPC1O14908 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GIPC1O14908 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GIPC1O14908 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GIPC1O14908 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GIPC1O14908 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GIPC1O14908 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GIPC1O14908 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GIPC1O14908 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GIPC1O14908 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GIPC1O14908 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GIPC1O14908 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GIPC1O14908 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GIPC1O14908 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GIPC1O14908 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GIPC1O14908 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GIPC1O14908 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GIPC1O14908 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GIPC1O14908 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GIPC1O14908 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GIPC1O14908 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GIPC1O14908 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GIPC1O14908 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GIPC1O14908 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GIPC1O14908 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GIPC1O14908 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GIPC1O14908 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GIPC1O14908 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GIPC1O14908 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GIPC1O14908 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GIPC1O14908 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GIPC1O14908 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GIPC1O14908 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GIPC1O14908 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GIPC1O14908 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GIPC1O14908 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GIPC1O14908 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GIPC1O14908 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GIPC1O14908 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GIPC1O14908 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GIPC1O14908 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GIPC1O14908 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GIPC1O14908 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GIPC1O14908 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GIPC1O14908 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GIPC1O14908 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GIPC1O14908 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GIPC1O14908 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GIPC1O14908 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GIPC1O14908 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GIPC1O14908 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GIPC1O14908 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GIPC1O14908 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GIPC1O14908 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GIPC1O14908 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GIPC1O14908 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GIPC1O14908 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 737.6 ms