Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TXNDC9O14530 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC9O14530 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC9O14530 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC9O14530 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC9O14530 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC9O14530 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TXNDC9O14530 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TXNDC9O14530 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.6 ms