Protein–RNA interactions for Protein: O00526

UPK2, Uroplakin-2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK2O00526 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK2O00526 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPK2O00526 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK2O00526 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK2O00526 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK2O00526 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK2O00526 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK2O00526 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK2O00526 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK2O00526 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK2O00526 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK2O00526 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK2O00526 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK2O00526 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK2O00526 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK2O00526 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK2O00526 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK2O00526 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK2O00526 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK2O00526 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK2O00526 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK2O00526 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK2O00526 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK2O00526 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK2O00526 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK2O00526 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK2O00526 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK2O00526 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK2O00526 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK2O00526 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK2O00526 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK2O00526 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK2O00526 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK2O00526 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK2O00526 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK2O00526 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK2O00526 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK2O00526 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK2O00526 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPK2O00526 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK2O00526 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK2O00526 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK2O00526 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK2O00526 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK2O00526 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK2O00526 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK2O00526 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK2O00526 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK2O00526 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK2O00526 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK2O00526 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK2O00526 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK2O00526 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK2O00526 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK2O00526 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK2O00526 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK2O00526 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK2O00526 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK2O00526 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK2O00526 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK2O00526 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK2O00526 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK2O00526 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK2O00526 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPK2O00526 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK2O00526 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK2O00526 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK2O00526 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK2O00526 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK2O00526 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK2O00526 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK2O00526 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPK2O00526 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UPK2O00526 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK2O00526 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK2O00526 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK2O00526 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK2O00526 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPK2O00526 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPK2O00526 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK2O00526 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK2O00526 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK2O00526 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK2O00526 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK2O00526 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK2O00526 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK2O00526 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK2O00526 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK2O00526 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK2O00526 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK2O00526 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK2O00526 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPK2O00526 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UPK2O00526 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK2O00526 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK2O00526 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK2O00526 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK2O00526 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK2O00526 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK2O00526 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms