Protein–RNA interactions for Protein: O00526

UPK2, Uroplakin-2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK2O00526 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPK2O00526 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPK2O00526 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPK2O00526 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UPK2O00526 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPK2O00526 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPK2O00526 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPK2O00526 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPK2O00526 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPK2O00526 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPK2O00526 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UPK2O00526 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPK2O00526 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPK2O00526 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPK2O00526 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK2O00526 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPK2O00526 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK2O00526 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPK2O00526 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPK2O00526 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPK2O00526 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UPK2O00526 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK2O00526 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPK2O00526 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPK2O00526 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPK2O00526 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK2O00526 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK2O00526 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK2O00526 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK2O00526 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPK2O00526 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK2O00526 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK2O00526 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPK2O00526 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK2O00526 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPK2O00526 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK2O00526 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK2O00526 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK2O00526 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK2O00526 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK2O00526 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK2O00526 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPK2O00526 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPK2O00526 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK2O00526 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPK2O00526 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPK2O00526 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPK2O00526 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPK2O00526 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPK2O00526 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK2O00526 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK2O00526 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UPK2O00526 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPK2O00526 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPK2O00526 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPK2O00526 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPK2O00526 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPK2O00526 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPK2O00526 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK2O00526 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK2O00526 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK2O00526 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UPK2O00526 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK2O00526 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK2O00526 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK2O00526 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK2O00526 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK2O00526 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK2O00526 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK2O00526 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK2O00526 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK2O00526 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK2O00526 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK2O00526 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK2O00526 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK2O00526 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK2O00526 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK2O00526 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK2O00526 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPK2O00526 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK2O00526 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK2O00526 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK2O00526 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK2O00526 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK2O00526 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK2O00526 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK2O00526 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK2O00526 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK2O00526 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK2O00526 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK2O00526 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPK2O00526 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPK2O00526 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPK2O00526 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK2O00526 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK2O00526 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK2O00526 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPK2O00526 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK2O00526 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK2O00526 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms