Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLOD2O00469 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLOD2O00469 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLOD2O00469 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLOD2O00469 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLOD2O00469 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLOD2O00469 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLOD2O00469 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLOD2O00469 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLOD2O00469 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLOD2O00469 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLOD2O00469 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLOD2O00469 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLOD2O00469 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLOD2O00469 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLOD2O00469 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLOD2O00469 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLOD2O00469 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLOD2O00469 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLOD2O00469 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLOD2O00469 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLOD2O00469 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLOD2O00469 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLOD2O00469 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLOD2O00469 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLOD2O00469 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PLOD2O00469 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLOD2O00469 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PLOD2O00469 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLOD2O00469 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLOD2O00469 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLOD2O00469 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLOD2O00469 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLOD2O00469 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLOD2O00469 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PLOD2O00469 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLOD2O00469 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLOD2O00469 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLOD2O00469 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLOD2O00469 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLOD2O00469 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLOD2O00469 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLOD2O00469 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLOD2O00469 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLOD2O00469 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLOD2O00469 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLOD2O00469 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLOD2O00469 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLOD2O00469 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLOD2O00469 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLOD2O00469 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLOD2O00469 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLOD2O00469 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLOD2O00469 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLOD2O00469 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLOD2O00469 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms