Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3KRW8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3KRW8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3KRW8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KRW8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KRW8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KRW8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KRW8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KRW8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KRW8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KRW8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KRW8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KRW8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KRW8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KRW8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KRW8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KRW8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KRW8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KRW8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KRW8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KRW8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
J3KRW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
J3KRW8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
J3KRW8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
J3KRW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3KRW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3KRW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3KRW8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3KRW8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3KRW8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3KRW8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3KRW8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3KRW8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3KRW8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3KRW8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KRW8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KRW8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KRW8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KRW8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KRW8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KRW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KRW8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KRW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KRW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KRW8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KRW8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KRW8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3KRW8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3KRW8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3KRW8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3KRW8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3KRW8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3KRW8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3KRW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3KRW8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3KRW8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3KRW8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3KRW8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KRW8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KRW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KRW8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KRW8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KRW8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KRW8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KRW8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KRW8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KRW8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KRW8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KRW8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KRW8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KRW8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KRW8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KRW8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KRW8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KRW8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KRW8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KRW8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KRW8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KRW8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KRW8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KRW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KRW8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KRW8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KRW8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KRW8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3KRW8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KRW8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KRW8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KRW8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KRW8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KRW8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KRW8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KRW8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KRW8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KRW8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KRW8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3KRW8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3KRW8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3KRW8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3KRW8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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