Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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