Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX2-CTNND1H3BSU7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX2-CTNND1H3BSU7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX2-CTNND1H3BSU7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX2-CTNND1H3BSU7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMX2-CTNND1H3BSU7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMX2-CTNND1H3BSU7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMX2-CTNND1H3BSU7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMX2-CTNND1H3BSU7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMX2-CTNND1H3BSU7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMX2-CTNND1H3BSU7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMX2-CTNND1H3BSU7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMX2-CTNND1H3BSU7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX2-CTNND1H3BSU7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMX2-CTNND1H3BSU7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMX2-CTNND1H3BSU7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMX2-CTNND1H3BSU7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMX2-CTNND1H3BSU7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX2-CTNND1H3BSU7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX2-CTNND1H3BSU7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX2-CTNND1H3BSU7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX2-CTNND1H3BSU7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX2-CTNND1H3BSU7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX2-CTNND1H3BSU7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX2-CTNND1H3BSU7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX2-CTNND1H3BSU7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMX2-CTNND1H3BSU7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMX2-CTNND1H3BSU7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX2-CTNND1H3BSU7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX2-CTNND1H3BSU7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX2-CTNND1H3BSU7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMX2-CTNND1H3BSU7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX2-CTNND1H3BSU7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX2-CTNND1H3BSU7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX2-CTNND1H3BSU7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMX2-CTNND1H3BSU7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms