Protein–RNA interactions for Protein: H3BS89

TMEM178B, Transmembrane protein 178B, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM178BH3BS89 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM178BH3BS89 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM178BH3BS89 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM178BH3BS89 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM178BH3BS89 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM178BH3BS89 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM178BH3BS89 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM178BH3BS89 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM178BH3BS89 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM178BH3BS89 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM178BH3BS89 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM178BH3BS89 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM178BH3BS89 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM178BH3BS89 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM178BH3BS89 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM178BH3BS89 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM178BH3BS89 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM178BH3BS89 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM178BH3BS89 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM178BH3BS89 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM178BH3BS89 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM178BH3BS89 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM178BH3BS89 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM178BH3BS89 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM178BH3BS89 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM178BH3BS89 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM178BH3BS89 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM178BH3BS89 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM178BH3BS89 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM178BH3BS89 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM178BH3BS89 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM178BH3BS89 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM178BH3BS89 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM178BH3BS89 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM178BH3BS89 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM178BH3BS89 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM178BH3BS89 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM178BH3BS89 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms