Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VWA3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F8VWA3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
F8VWA3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8VWA3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VWA3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VWA3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VWA3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VWA3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VWA3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VWA3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VWA3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VWA3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VWA3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VWA3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VWA3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VWA3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F8VWA3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
F8VWA3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8VWA3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8VWA3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VWA3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VWA3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VWA3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VWA3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VWA3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VWA3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8VWA3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8VWA3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8VWA3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VWA3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VWA3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
F8VWA3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VWA3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VWA3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VWA3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VWA3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VWA3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VWA3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VWA3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VWA3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VWA3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VWA3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VWA3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VWA3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VWA3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VWA3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VWA3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VWA3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VWA3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VWA3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VWA3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VWA3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VWA3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VWA3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VWA3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VWA3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8VWA3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8VWA3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8VWA3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8VWA3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VWA3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8VWA3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8VWA3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8VWA3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8VWA3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
F8VWA3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VWA3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VWA3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VWA3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
F8VWA3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
F8VWA3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F8VWA3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VWA3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VWA3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F8VWA3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
F8VWA3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8VWA3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8VWA3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8VWA3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8VWA3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8VWA3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F8VWA3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8VWA3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8VWA3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8VWA3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8VWA3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8VWA3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8VWA3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8VWA3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8VWA3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8VWA3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
F8VWA3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F8VWA3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8VWA3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8VWA3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8VWA3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8VWA3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8VWA3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F8VWA3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms