Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4DXG7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4DXG7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4DXG7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4DXG7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
B4DXG7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4DXG7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4DXG7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4DXG7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4DXG7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
B4DXG7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
B4DXG7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
B4DXG7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
B4DXG7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4DXG7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4DXG7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4DXG7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4DXG7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4DXG7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4DXG7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4DXG7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4DXG7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4DXG7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4DXG7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4DXG7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4DXG7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DXG7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4DXG7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4DXG7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DXG7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DXG7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DXG7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DXG7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DXG7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4DXG7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4DXG7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DXG7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DXG7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DXG7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DXG7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DXG7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DXG7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DXG7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DXG7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DXG7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DXG7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DXG7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DXG7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DXG7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DXG7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DXG7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4DXG7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4DXG7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4DXG7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4DXG7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4DXG7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4DXG7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4DXG7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4DXG7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4DXG7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4DXG7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4DXG7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
B4DXG7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4DXG7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4DXG7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4DXG7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4DXG7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4DXG7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
B4DXG7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4DXG7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4DXG7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4DXG7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4DXG7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4DXG7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4DXG7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4DXG7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4DXG7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4DXG7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4DXG7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4DXG7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
B4DXG7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4DXG7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4DXG7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DXG7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DXG7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4DXG7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4DXG7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4DXG7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
B4DXG7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4DXG7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4DXG7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4DXG7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4DXG7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4DXG7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4DXG7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4DXG7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4DXG7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4DXG7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4DXG7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4DXG7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms