Protein–RNA interactions for Protein: A8MXK1

VSTM5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM5A8MXK1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM5A8MXK1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM5A8MXK1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM5A8MXK1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM5A8MXK1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM5A8MXK1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSTM5A8MXK1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM5A8MXK1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM5A8MXK1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM5A8MXK1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VSTM5A8MXK1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM5A8MXK1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM5A8MXK1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM5A8MXK1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM5A8MXK1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM5A8MXK1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM5A8MXK1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM5A8MXK1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VSTM5A8MXK1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM5A8MXK1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM5A8MXK1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM5A8MXK1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM5A8MXK1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM5A8MXK1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM5A8MXK1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM5A8MXK1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM5A8MXK1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM5A8MXK1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VSTM5A8MXK1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM5A8MXK1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM5A8MXK1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM5A8MXK1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM5A8MXK1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSTM5A8MXK1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM5A8MXK1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM5A8MXK1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM5A8MXK1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM5A8MXK1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM5A8MXK1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM5A8MXK1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM5A8MXK1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM5A8MXK1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM5A8MXK1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM5A8MXK1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM5A8MXK1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM5A8MXK1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM5A8MXK1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM5A8MXK1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM5A8MXK1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSTM5A8MXK1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM5A8MXK1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM5A8MXK1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM5A8MXK1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM5A8MXK1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM5A8MXK1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM5A8MXK1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM5A8MXK1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM5A8MXK1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM5A8MXK1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSTM5A8MXK1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM5A8MXK1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM5A8MXK1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms