Protein–RNA interactions for Protein: A8MV72

Putative UPF0607 protein ENSP00000382826, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MV72 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A8MV72 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A8MV72 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A8MV72 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MV72 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MV72 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MV72 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A8MV72 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A8MV72 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
A8MV72 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A8MV72 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A8MV72 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A8MV72 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A8MV72 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A8MV72 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A8MV72 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A8MV72 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A8MV72 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
A8MV72 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A8MV72 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A8MV72 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A8MV72 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A8MV72 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A8MV72 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A8MV72 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A8MV72 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A8MV72 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A8MV72 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A8MV72 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A8MV72 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A8MV72 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A8MV72 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A8MV72 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A8MV72 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A8MV72 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A8MV72 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A8MV72 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A8MV72 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A8MV72 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A8MV72 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A8MV72 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A8MV72 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A8MV72 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
A8MV72 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A8MV72 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A8MV72 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A8MV72 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A8MV72 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A8MV72 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A8MV72 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A8MV72 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A8MV72 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A8MV72 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A8MV72 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A8MV72 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A8MV72 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A8MV72 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A8MV72 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A8MV72 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A8MV72 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A8MV72 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A8MV72 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A8MV72 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A8MV72 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A8MV72 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A8MV72 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A8MV72 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A8MV72 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A8MV72 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A8MV72 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A8MV72 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A8MV72 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A8MV72 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A8MV72 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
A8MV72 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A8MV72 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A8MV72 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A8MV72 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A8MV72 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A8MV72 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A8MV72 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A8MV72 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A8MV72 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A8MV72 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A8MV72 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A8MV72 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A8MV72 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A8MV72 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A8MV72 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A8MV72 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A8MV72 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A8MV72 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A8MV72 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A8MV72 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A8MV72 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A8MV72 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A8MV72 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A8MV72 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A8MV72 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A8MV72 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms