Protein–RNA interactions for Protein: A6NLI5

TRIM64C, Putative tripartite motif-containing protein 64C, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64CA6NLI5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM64CA6NLI5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM64CA6NLI5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM64CA6NLI5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM64CA6NLI5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM64CA6NLI5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM64CA6NLI5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM64CA6NLI5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM64CA6NLI5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM64CA6NLI5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM64CA6NLI5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM64CA6NLI5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM64CA6NLI5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM64CA6NLI5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM64CA6NLI5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM64CA6NLI5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM64CA6NLI5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM64CA6NLI5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM64CA6NLI5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM64CA6NLI5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM64CA6NLI5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM64CA6NLI5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM64CA6NLI5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM64CA6NLI5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM64CA6NLI5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM64CA6NLI5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64CA6NLI5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64CA6NLI5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM64CA6NLI5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM64CA6NLI5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM64CA6NLI5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM64CA6NLI5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM64CA6NLI5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM64CA6NLI5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM64CA6NLI5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM64CA6NLI5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM64CA6NLI5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM64CA6NLI5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM64CA6NLI5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM64CA6NLI5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM64CA6NLI5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM64CA6NLI5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM64CA6NLI5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM64CA6NLI5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM64CA6NLI5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM64CA6NLI5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM64CA6NLI5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM64CA6NLI5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM64CA6NLI5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM64CA6NLI5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM64CA6NLI5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM64CA6NLI5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM64CA6NLI5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM64CA6NLI5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM64CA6NLI5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM64CA6NLI5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM64CA6NLI5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM64CA6NLI5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM64CA6NLI5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM64CA6NLI5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM64CA6NLI5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM64CA6NLI5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM64CA6NLI5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM64CA6NLI5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM64CA6NLI5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM64CA6NLI5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM64CA6NLI5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM64CA6NLI5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM64CA6NLI5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM64CA6NLI5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM64CA6NLI5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM64CA6NLI5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM64CA6NLI5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM64CA6NLI5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM64CA6NLI5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM64CA6NLI5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM64CA6NLI5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM64CA6NLI5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms