Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN8A6NHC0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN8A6NHC0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN8A6NHC0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN8A6NHC0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN8A6NHC0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN8A6NHC0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN8A6NHC0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN8A6NHC0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN8A6NHC0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN8A6NHC0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN8A6NHC0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN8A6NHC0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN8A6NHC0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN8A6NHC0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN8A6NHC0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN8A6NHC0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN8A6NHC0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN8A6NHC0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN8A6NHC0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN8A6NHC0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN8A6NHC0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN8A6NHC0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN8A6NHC0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN8A6NHC0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN8A6NHC0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN8A6NHC0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN8A6NHC0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN8A6NHC0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN8A6NHC0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN8A6NHC0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN8A6NHC0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAPN8A6NHC0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN8A6NHC0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN8A6NHC0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN8A6NHC0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN8A6NHC0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN8A6NHC0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN8A6NHC0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN8A6NHC0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN8A6NHC0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN8A6NHC0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN8A6NHC0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN8A6NHC0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN8A6NHC0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN8A6NHC0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN8A6NHC0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN8A6NHC0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN8A6NHC0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN8A6NHC0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN8A6NHC0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN8A6NHC0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN8A6NHC0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN8A6NHC0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN8A6NHC0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN8A6NHC0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN8A6NHC0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN8A6NHC0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN8A6NHC0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN8A6NHC0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CAPN8A6NHC0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN8A6NHC0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN8A6NHC0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN8A6NHC0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN8A6NHC0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN8A6NHC0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN8A6NHC0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN8A6NHC0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms