Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms