Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRP5LA4QPB2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRP5LA4QPB2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5LA4QPB2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5LA4QPB2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5LA4QPB2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRP5LA4QPB2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP5LA4QPB2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms