Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRAMEF22A3QJZ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
PRAMEF22A3QJZ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRAMEF22A3QJZ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRAMEF22A3QJZ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRAMEF22A3QJZ6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRAMEF22A3QJZ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRAMEF22A3QJZ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRAMEF22A3QJZ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRAMEF22A3QJZ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAMEF22A3QJZ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAMEF22A3QJZ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRAMEF22A3QJZ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRAMEF22A3QJZ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRAMEF22A3QJZ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRAMEF22A3QJZ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PRAMEF22A3QJZ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PRAMEF22A3QJZ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRAMEF22A3QJZ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PRAMEF22A3QJZ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRAMEF22A3QJZ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRAMEF22A3QJZ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRAMEF22A3QJZ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRAMEF22A3QJZ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRAMEF22A3QJZ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRAMEF22A3QJZ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
PRAMEF22A3QJZ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRAMEF22A3QJZ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRAMEF22A3QJZ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PRAMEF22A3QJZ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRAMEF22A3QJZ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRAMEF22A3QJZ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRAMEF22A3QJZ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRAMEF22A3QJZ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRAMEF22A3QJZ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRAMEF22A3QJZ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRAMEF22A3QJZ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRAMEF22A3QJZ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRAMEF22A3QJZ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRAMEF22A3QJZ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRAMEF22A3QJZ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRAMEF22A3QJZ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRAMEF22A3QJZ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PRAMEF22A3QJZ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRAMEF22A3QJZ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PRAMEF22A3QJZ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRAMEF22A3QJZ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRAMEF22A3QJZ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRAMEF22A3QJZ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PRAMEF22A3QJZ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRAMEF22A3QJZ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRAMEF22A3QJZ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRAMEF22A3QJZ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRAMEF22A3QJZ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRAMEF22A3QJZ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRAMEF22A3QJZ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRAMEF22A3QJZ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
PRAMEF22A3QJZ6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRAMEF22A3QJZ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRAMEF22A3QJZ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRAMEF22A3QJZ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRAMEF22A3QJZ6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRAMEF22A3QJZ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRAMEF22A3QJZ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRAMEF22A3QJZ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRAMEF22A3QJZ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRAMEF22A3QJZ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRAMEF22A3QJZ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRAMEF22A3QJZ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRAMEF22A3QJZ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms