Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPDC1A2A3K4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPDC1A2A3K4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPDC1A2A3K4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPDC1A2A3K4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPDC1A2A3K4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPDC1A2A3K4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPDC1A2A3K4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPDC1A2A3K4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPDC1A2A3K4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPDC1A2A3K4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPDC1A2A3K4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPDC1A2A3K4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPDC1A2A3K4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPDC1A2A3K4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPDC1A2A3K4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPDC1A2A3K4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPDC1A2A3K4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPDC1A2A3K4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPDC1A2A3K4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPDC1A2A3K4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPDC1A2A3K4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPDC1A2A3K4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPDC1A2A3K4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPDC1A2A3K4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPDC1A2A3K4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPDC1A2A3K4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPDC1A2A3K4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPDC1A2A3K4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPDC1A2A3K4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPDC1A2A3K4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPDC1A2A3K4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPDC1A2A3K4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPDC1A2A3K4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPDC1A2A3K4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPDC1A2A3K4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPDC1A2A3K4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPDC1A2A3K4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPDC1A2A3K4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPDC1A2A3K4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPDC1A2A3K4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPDC1A2A3K4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPDC1A2A3K4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPDC1A2A3K4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPDC1A2A3K4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPDC1A2A3K4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPDC1A2A3K4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPDC1A2A3K4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPDC1A2A3K4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPDC1A2A3K4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPDC1A2A3K4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPDC1A2A3K4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPDC1A2A3K4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPDC1A2A3K4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPDC1A2A3K4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPDC1A2A3K4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPDC1A2A3K4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPDC1A2A3K4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPDC1A2A3K4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPDC1A2A3K4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPDC1A2A3K4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPDC1A2A3K4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms