Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQV1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RQV1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RQV1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RQV1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RQV1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RQV1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RQV1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RQV1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RQV1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RQV1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0U1RQV1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RQV1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RQV1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RQV1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RQV1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RQV1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RQV1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0U1RQV1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0U1RQV1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0U1RQV1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0U1RQV1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A0A0U1RQV1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RQV1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RQV1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RQV1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RQV1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RQV1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RQV1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RQV1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0U1RQV1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0U1RQV1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A0A0U1RQV1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms