Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQV1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQV1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQV1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQV1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
A0A0U1RQV1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQV1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A0A0U1RQV1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
A0A0U1RQV1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
A0A0U1RQV1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A0A0U1RQV1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A0U1RQV1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RQV1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RQV1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0U1RQV1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A0A0U1RQV1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RQV1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RQV1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RQV1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RQV1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RQV1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0U1RQV1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RQV1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RQV1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RQV1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RQV1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RQV1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RQV1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RQV1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RQV1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0U1RQV1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RQV1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RQV1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RQV1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A0U1RQV1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RQV1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RQV1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RQV1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RQV1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0U1RQV1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0U1RQV1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0U1RQV1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0U1RQV1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RQV1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RQV1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RQV1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RQV1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0U1RQV1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0U1RQV1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RQV1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RQV1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RQV1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RQV1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RQV1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RQV1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RQV1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RQV1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RQV1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RQV1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RQV1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RQV1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RQV1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RQV1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RQV1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RQV1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RQV1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0U1RQV1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A0A0U1RQV1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A0U1RQV1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A0U1RQV1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A0A0U1RQV1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A0A0U1RQV1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A0A0U1RQV1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A0A0U1RQV1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A0U1RQV1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A0A0U1RQV1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0U1RQV1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RQV1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RQV1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RQV1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A0A0U1RQV1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0U1RQV1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A0A0U1RQV1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A0A0U1RQV1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A0A0U1RQV1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A0A0U1RQV1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0U1RQV1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0U1RQV1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
A0A0U1RQV1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
A0A0U1RQV1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A0U1RQV1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A0U1RQV1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A0A0U1RQV1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A0A0U1RQV1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A0A0U1RQV1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0U1RQV1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0U1RQV1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RQV1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RQV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RQV1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RQV1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms