Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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